En esta misma sala se encuentra la sección de publicaciones de don Andrés Henestrosa, que se compone de sus obras y de otras en las que participó escribiendo el prólogo o la introducción. En esta primera sala también se ubica el Fondo Reservado, integrado por ediciones de los siglos XVII, XVIII y XIX sobre historia, literatura, lingüística y publicaciones periódicas.

En la segunda sala continúan los géneros de Poesía, Ensayo y Teatro, y se encuentran las secciones de Lingüística, Filosofía, Educación, Derecho, Sociología, Administración y Religión. En esta misma sala se encuentra otro de los ejes principales de la biblioteca: la sección de Historia, ordenada cronológicamente, y que constituye una de las colecciones más completas sobre este tema en Oaxaca.

En la tercera sala continúan los períodos históricos correspondientes a la Revolución y Época Contemporánea, y se encuentran las Secciones de Antropología, Arqueología, Etnología, Biografía, Arte, Arquitectura y Urbanismo, Publicaciones Oficiales, Política y Ciencia.

Las dos salas de lectura dispuestas albergan, una, la sección de Revistas coleccionadas por don Andrés y la otra, la sección de Consulta, compuesta por diccionarios, enciclopedias, atlas, bibliografías, almanaques, catálogos, etc.

De reciente apertura, una sala aloja la biblioteca de Francisco Javier Hernández, un reconocido investigador del arte popular mexicano, así como las donaciones recibidas de diferentes personas e instituciones, como Fundación Alfredo Harp Helú Oaxaca, A. C., la Universidad Nacional Autónoma de México, la Benemérita Universidad Autónoma de Puebla, María Luisa de Villa, Pedro Delint, Yurik Kifuri, Amelia Lara, entre otros.

La colección, publicada en su mayor parte durante la primera mitad del siglo XX, es una muestra de los principales movimientos culturales que se dieron en México y en Hispanoamérica. En los dos temas abordados con mayor amplitud por esta colección, como la historia de México y la literatura hispanoamericana, se advierte el interés especial de don Andrés Henestrosa en estos tópicos, y su vocación liberal.